В данном случае вам необходимо обратиться с жалобой на работодателя в налоговую службу. С 1 января 2017 года ФНС занимается проверкой правильности расчета, а также уплаты страховых взносов. В жалобе вам следует подробно указать с какого по какой период вы работали у вашего работодателя, размер вашей заработной платы, а также уведомить ФНС о том, что работодатель не выплатил все страховые взносы.
Также вы можете продублировать жалобу на работодателя в прокуратуру с указанием тех же нарушений порядка расчета и уплаты страховых взносов.