К сожалению, правовых оснований подавать в отношении вашего бывшего работодателя заявление о возбуждении уголовного дела нет, поскольку в его действиях отсутствуют признаки состава уголовного преступления.
Для обжалования незаконных действий работодателя в рамках судебного разбирательства в гражданском порядке истек срок исковой давности.
В вашем случае мы бы хотели порекомендовать вам сосредоточиться на уголовном деле.
В виду того, что вы не уточнили по какой статье возбуждено уголовное дело, можем предположить, что возбуждено он по ст. 159 УК РФ "Мошенничество".
Если мы правы и дело возбуждено по этой статье, то вам следует обжаловать постановление о возбуждении уголовного дела и требовать прекращения уголовного дела, поскольку у вас не было никакого умысла на хищение денежных средств путем представления такого больничного листа. А мошенничество как преступление характеризуется именно умыслом на хищение имущества путем обмана.
Представив больничный лист вы лишь пытались оградить себя от нарушения ваших прав работодателем. Выплат по больничному листу вы не получали, на выплатах сами не настаивали. Все это указывает на отсутсвие умысла и как следствие отсутствие состава уголовного преступления "Мошенничество".