Так как работодатель прекращает свою деятельность в Москве и перемещается в Санкт-Петербург, то он не ликвидирует организацию, а меняет место расположения. Согласно статье 261 Трудового Кодекса РФ, расторжение трудового договора с женщиной, имеющей ребенка в возрасте до трех лет, по инициативе работодателя не допускается (за исключением увольнения при ликвидации организации либо прекращения деятельности индивидуальным предпринимателем).
Вы, можете расторгнуть трудовой договор по соглашению сторон и в этом соглашении отразить размер денежной компенсации.
В других случаях работодатель может расторгнуть трудовой договор только по решению суда.